Para integrar Git con el almacen de credenciales de Gnome hay que instalar el programa git-credential-libsecret.
En Fedora, está disponible en el paquete git-credential-libsecret de los repositorios oficiales.
Se configura en el terminal con la siguiente sentencia de línea de comandos:
git config --global credential.helper /usr/libexec/git-core/git-credential-libsecret